有機官能硅烷通常用于色譜法（分離技術）中，以分離物質混合物。這些雜化分子在單個分子中結合了反應性有機基團的功能性與無機功能性。

有機官能硅烷具有兩個反應中心。其中之一的特征在于至少一個水解穩定的碳-硅鍵。由此可以引入有機殘基，例如烷基，芳基，全氟苯基烷基，環氧基，醛基或酸酐基團。

硅原子上的其他反應中心由可水解基團組成。這些主要是氯，烷氧基和氨基，它們很容易水解成硅烷醇。此外，硅可以通過硅氧烷鍵共價鍵合至無機表面。硅-碳鍵的疏水性在ji端pH條件下在硅氧烷鍵和底物之間的邊界處提供了改善的水解穩定性。由于改進了對二氧化硅材料的機械性能的保護，因此導致更長的使用壽命。通常需要催化劑以引發水解反應。通常使用弱酸或弱堿。氯硅烷和氨基硅烷會自動催化反應，因為可水解基團可在原位生成鹽酸或胺。